براسا‌س قانون اتاق بازرگانی این نهاد هر چهار سال یک بار انتخابات سراسری برگزار می‌کند و واجدان شرایطی که تمایل به مشارکت دارند در انتخابات به کاندیداهای هر استان رای می‌دهند و از میان کاندیداها کسانی به عنوان هیات نمایندگان به اتاق ایران راه می‌یابند. باز هم براساس قانون اعضای هیات نمایندگان در یک انتخابات سراسری از میان کاندیداهای ریاست اتاق یک نفر را به عنوان رییس اتاق بازرگانی به مدت چهار سال برمی‌گزینند. در شش سال گذشته غلامحسین شافعی با رای اعضای هیات نمایندگان، ریاست اتاق را برعهده داشت و دو سال نیز محسن جلالی‌پور و پیش از او نیز محمد نهاوندیان ریاست اتاق را برعهده داشتند. در ۲۸ خرداد امسال نیز یکی از کاندیداها با کسب ۲۶۵ رای از کسانی که در انتخابات حاضر بودند منتخب اعضا برای ریاست بوده است. در هفته‌های پیش از برگزاری انتخابات و در این ۴۰ روز پس از انتخابات دولت تعرضی به آن نداشته است و رییس نیز در دفتر کارش بوده است. با این همه برخی افراد که سابقه فعالیت در اتاق را دارند با استناد به مقررات و برخی دیگر از مسائل باور دارند که فرد برگزیده صلاحیت ندارد. یکی از تندترین مسائل علیه رییس اتاق این است که وی از برخی نهادهای مهم اطلاع پیدا می‌کند و این برای کشور مساله درست می‌کند‌. ضمن تاکید براینکه روسای اتاق در چهار دهه اخیر هرگز در این باره نکوهش نشده‌اند. به این ترتیب باید حضور رییس اتاق در برخی مراکز تصمیم‌گیری لغو شود و تصمیم‌های اتخاذشده پس از آن در اختیار اتاق قرار گیرد. واقعیت این است که حضور افراد عضو اتاق در مراکز تصمیم‌گیری بدون حق رای، امتیاز قابل اعتنایی نیست و نمی‌توان در وقت مناسب در این باره راهی را جست‌وجو کرد. عقل و منطق و توجه و احترام به بخش خصوصی حکم می‌کند تصمیم درست گرفته شود.