برحسب مصوبات هیات محترم وزیران بنادر شهید رجایی، بوشهر و امیرآباد بعنوان مناطق ویژه اقتصادی بندری ایجاد و سازمان بنادر و کشتیرانی بعنوان سازمان مسئول این مناطق تعیین گردیده است. نظر به ابلاغ قانون تشکیل و اداره مناطق ویژه اقتصادی مصوب 11/3/1384 و آیئن نامه اجرایی مربوطه مصوب 1/3/1385 ، سازمان مسئول منطقه ملزم به اجرای کامل قوانین و مقررات و انطباق کلیه رویه های اعمالی با مقررات مربوطه می باشد. لذا در راستای اجرای تکالیف قانونی و بر اساس مفاد ماده 19 قانون مزبور، اعلام میدارد که از تاریخ 1/5/87 تمامی رویه های اعمالی در مناطق ویژه اقتصادی بندری شهید رجایی، بوشهر و امیرآباد برابر مفاد قانون یاد شده و تحت رویه ای واحد و یکپارچه صورت می پذیرد. بنابراین از تاریخ مذکور به بعد ورود و خروج کلیه کالاها و پذیرش شناور حامل کالا و تخلیه و بارگیری آن در مناطق یاد شده مشمول قوانین و مقررات حاکم بر مناطق ویژه بوده و براساس رویه واحد با آن رفتار خواهد شد و تفکیک رویه های عادی و ویژه در این بنادر امکان پذیر نخواهد بود.